Edustusjoukkueen toiminnasta vastaa JJK Jyväskylä ry. JJK Jyväskylä -nimellä pelaava Joukkue pelaa kaudella 2024 Miesten Ykkösessä.
B-nuorten (U16/U17) joukkuetoimintaa hallinnoi JyPK-JJK Juniorit ry, mutta sen sarjapaikat ovat JJK Jyväskylä ry:n nimissä, mikä mahdollistaa B-juniori-ikäisten poikien pelaamisen seuran edustusjoukkueessa sekä alemmissa aikuisten sarjoissa pelaavissa JJK Jyväskylän joukkueissa.